Brugervejledning til slidescanning

Når du bliver oprettet som bruger i VIRMIK, bliver du automatisk tildelt en rolle i systemet, enten SlideOwner, Instructor eller student. Her på siden finder du vejledning særligt rettet mod SlideOwners.

Vejledning til slidescanning
1. For at kunne scanne slides til VIRMIK skal du være oprettet som SlideOwner i det Topic, hvor du skal scanne.

2. Du kan blive oprettet som SlideOwner ved henvendelse til Niels Werner Mortensen

3. Du skal beslutte, hvilken af SUND´s slide scannere du vil anvende:

  • 3D Histech Pannoramic DESK er placeret hos ICMM på Panum i lokale 22.3.23
  • Hamamatsu Nanozoomer placeret på FinsenLab, BRIC, Ole Maaløes Vej 5, 3. sal
  • Zeiss AxioScan.Z1 er placeret i CFIM´s lokaler på Panum
  • Olympus VS120 er placeret i kælderen ved IVS på Frederiksberg Campus

4. Alle slide scannere er styret af en tilsluttet PC, der er en del af SUND's Windows domæne og du skal logge på denne med din SUND bruger konto.

5. Når du er oprettet som SlideOwner har du adgang til at gemme dine slidefiler i Repository for dit Topic.

6. Repository for Pannoramic DESK formatet finder du på N:\VIRMIK\VIRMIK4_MRXS.
Repository for Aperio formatet finder du på N:\VIRMIK\VIRMIK4_SVS
Repository for Hamamatsu formatet finder du på N:\VIRMIK\VIRMIK4_NDPI
Repository for AxioScan.Z1 formatet finder du på N:\VIRMIK\VIRMIK4_CZI

7. I forbindelse med slide scanning kan du gemme dine slidefiler direkte i Repository. Hvis netværksforbindelsen er ustabil kan du gemme dine slidefiler lokalt på slide scanner PC’en og manuelt flytte dem til Repository, når slide scanning er afsluttet.

8. Ved navngivning af slidefiler kan følgende tegn anvendes:
Udråbstegn !
Dollar tegn $
Bløde parenteser ( )
Minus tegn -
Punktum .
Semicolon ;
Tilde ~
Underscore _
Numeriske tal 0-9
Commercial at @
Engelske tegn A-Z og a-z

Note1: Brug af andre tegn end ovenstående i slidefil navne er ikke supporteret.
Note2: Slidefiler med navne på mere end 24 tegn er ikke supporteret.

10. Efter slide scanning kan du logge på VIRMIK via en web browser og gå i Control Panel for at importere slides, forsyne dem med navn, medicinsk/veterinær tekst, evt. annotations og til sidst vælge at publishe slides. Kun SlideOwner kan publishe/un-publishe slides og kun indenfor eget Topic. Se den særlige vejledning udgivet af Steen Seier Poulsen, BMI.